Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN9Q5TKA1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms