Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms