Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP2LQ5T4T6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms