Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIF1Q5T3J3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIF1Q5T3J3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms