Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN11Q5T124 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN11Q5T124 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN11Q5T124 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms