Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3CD-AS1Q5SR53 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms