Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP2Q5QGT7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms