Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC27A3Q5K4L6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC27A3Q5K4L6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms