Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms