Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM41BQ5BJD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM41BQ5BJD5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms