Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF394Q53GI3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF394Q53GI3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms