Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC44A4Q53GD3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A4Q53GD3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms