Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP28Q4G0W2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP28Q4G0W2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms