Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED5Q49AG3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED5Q49AG3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED5Q49AG3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms