Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms