Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM12Q3MHD2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM12Q3MHD2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms