Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF8Q3BBV2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms