Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTU2Q2VPK5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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