Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms