Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2B3Q16720 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2B3Q16720 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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