Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMB1Q16558 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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KCNMB1Q16558 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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KCNMB1Q16558 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNMB1Q16558 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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