Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GRIK5Q16478 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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