Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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TNXAQ16473 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNXAQ16473 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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