Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZIC1Q15915 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC1Q15915 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms