Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEBPEQ15744 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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