Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKIV2LQ15477 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIV2LQ15477 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms