Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A1Q15459 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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