Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR6A1Q15406 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR6A1Q15406 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR6A1Q15406 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR6A1Q15406 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NR6A1Q15406 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms