Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NECTIN1Q15223 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NECTIN1Q15223 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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