Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD1Q15116 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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