Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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