Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PITRM1-208ENST00000455371 673 ntTSL 27.37□□□□□ -1.233e-11■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 CYB5R1-202ENST00000446185 680 ntTSL 53.2□□□□□ -1.96e-7■■■■■ 48
EFTUD2Q15029 C7orf43-209ENST00000472061 356 ntTSL 314.72□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 219.9■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 CTU2-205ENST00000564584 896 ntTSL 313.61□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 NDUFS8-205ENST00000525419 561 ntTSL 319.89■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 NDUFS8-208ENST00000526446 814 ntTSL 516.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 NDUFS8-207ENST00000526339 689 ntTSL 212.77□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 NDUFS8-210ENST00000528492 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 ACTB-213ENST00000493945 1236 ntTSL 514.67□□□□□ -0.064e-36■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-223ENST00000546312 564 ntTSL 29.35□□□□□ -0.911e-17■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 215.49■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 NAPRT-210ENST00000491904 641 ntTSL 317.56■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 47.9
EFTUD2Q15029 NDUFV1-228ENST00000534352 573 ntTSL 217.28■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 NDUFV1-220ENST00000531250 736 ntTSL 216.46■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 SSBP4-212ENST00000601919 492 ntTSL 518.53■□□□□ 0.568e-8■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.53□□□□□ -21e-63■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 USP14-204ENST00000578786 1104 ntTSL 53.76□□□□□ -1.816e-7■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 HMGN1-215ENST00000485550 745 ntTSL 59.8□□□□□ -0.842e-22■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 BAG6-262ENST00000470875 1000 ntTSL 520.83■□□□□ 0.936e-14■■■■■ 47.8
EFTUD2Q15029 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 NAP1L4-208ENST00000483643 690 ntTSL 26.6□□□□□ -1.351e-9■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 NAP1L4-215ENST00000528363 685 ntTSL 26.6□□□□□ -1.351e-9■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 NAP1L4-214ENST00000528261 644 ntTSL 24.31□□□□□ -1.721e-9■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 DECR2-207ENST00000461749 2062 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 MCFD2-216ENST00000487121 627 ntTSL 314.52□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 47.7
EFTUD2Q15029 LPCAT4-205ENST00000563748 1357 ntTSL 216.13■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 47.6
EFTUD2Q15029 LPCAT4-207ENST00000567507 672 ntTSL 38.59□□□□□ -1.035e-10■■■■■ 47.6
EFTUD2Q15029 CFAP20-207ENST00000567660 731 ntTSL 216.27■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 47.6
EFTUD2Q15029 CFAP20-205ENST00000565880 572 ntTSL 314.7□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 47.6
EFTUD2Q15029 CFAP20-203ENST00000562622 1605 ntTSL 514.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 47.6
EFTUD2Q15029 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 47.6
EFTUD2Q15029 CFAP20-206ENST00000567092 710 ntTSL 211.22□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 47.6
EFTUD2Q15029 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.037e-13■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.317e-13■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 MRPL55-234ENST00000497758 470 ntTSL 311.29□□□□□ -0.67e-13■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 NDUFS8-204ENST00000524810 616 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-8■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 HMGN1-211ENST00000471260 615 ntTSL 312.62□□□□□ -0.392e-22■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 HMGN1-213ENST00000482192 793 ntTSL 311.26□□□□□ -0.612e-22■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.035e-11■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.965e-11■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 RACK1-233ENST00000514455 791 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 47.5
EFTUD2Q15029 HDAC3-210ENST00000490808 605 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-17■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.663e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.663e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-220ENST00000488119 1121 ntTSL 221.61■■□□□ 1.053e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.683e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-217ENST00000469963 1682 ntTSL 519.17■□□□□ 0.663e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-218ENST00000480913 937 ntTSL 518.21■□□□□ 0.513e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-214ENST00000416410 887 ntTSL 217.5■□□□□ 0.393e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-215ENST00000436437 882 ntTSL 316.75■□□□□ 0.273e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-216ENST00000437288 724 ntTSL 511.87□□□□□ -0.513e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 DDAH2-219ENST00000483792 898 ntTSL 511.83□□□□□ -0.523e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.772e-9■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 523.42■■□□□ 1.342e-9■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 RHEB-202ENST00000470072 764 ntTSL 44.27□□□□□ -1.732e-9■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.015e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.055e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-224ENST00000514731 1371 ntTSL 213.96□□□□□ -0.175e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.195e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 213.82□□□□□ -0.25e-14■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 PCCB-206ENST00000465423 582 ntTSL 414.23□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 PCCB-219ENST00000494742 547 ntTSL 413.57□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 PCCB-203ENST00000462542 488 ntTSL 310.75□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 PCCB-202ENST00000459873 534 ntTSL 48.97□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 PCCB-205ENST00000465176 570 ntTSL 58.93□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 47.4
EFTUD2Q15029 PPP2R1A-208ENST00000473820 646 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 47.3
EFTUD2Q15029 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 214.67□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 47.3
EFTUD2Q15029 RANBP1-209ENST00000432879 744 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 47.3
EFTUD2Q15029 RANBP1-212ENST00000467920 529 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 47.3
EFTUD2Q15029 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 47.3
EFTUD2Q15029 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 212.8□□□□□ -0.363e-10■■■■■ 47.3
EFTUD2Q15029 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-10■■■■■ 47.3
EFTUD2Q15029 NXF1-208ENST00000531131 1023 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.655e-8■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 MGAT4B-216ENST00000520969 1096 ntTSL 321.16■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 MGAT4B-220ENST00000522451 583 ntTSL 217.33■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 MGAT4B-219ENST00000522293 759 ntTSL 313.01□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 MGAT4B-214ENST00000520875 964 ntTSL 510.51□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.776e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-206ENST00000588347 753 ntTSL 220.61■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-203ENST00000586575 932 ntTSL 518.79■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-202ENST00000585858 656 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-207ENST00000588962 788 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 YIPF2-205ENST00000587943 796 ntTSL 516.4■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 47.2
EFTUD2Q15029 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 317.14■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GSK3A-203ENST00000453535 1897 ntTSL 529.06■■■□□ 2.241e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNPH1-204ENST00000509253 834 ntTSL 328.58■■■□□ 2.176e-7■■■■■ 47.1
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