Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NWD1Q149M9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NWD1Q149M9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NWD1Q149M9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
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