Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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