Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SQLEQ14534 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SQLEQ14534 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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