Protein–RNA interactions for Protein: Q14151

SAFB2, Scaffold attachment factor B2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFB2Q14151 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.54e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ARL15-204ENST00000505630 628 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ARL15-203ENST00000505383 536 ntTSL 312.96□□□□□ -0.334e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.454e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.454e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ARL15-206ENST00000510591 804 ntTSL 55.16□□□□□ -1.584e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ABCF2-203ENST00000441774 941 ntTSL 329.43■■■□□ 2.35e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ABCF2-206ENST00000477252 249 ntTSL 324.99■■□□□ 1.595e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.595e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.765e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-204ENST00000369462 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-207ENST00000411985 688 ntTSL 513.31□□□□□ -0.285e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.715e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.885e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-208ENST00000453705 2694 ntTSL 59.55□□□□□ -0.885e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ZNF544-203ENST00000594384 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-13■□□□□ 11
SAFB2Q14151 ZNF544-212ENST00000598880 570 ntTSL 513.82□□□□□ -0.21e-13■□□□□ 11
SAFB2Q14151 SPG7-217ENST00000568151 544 ntTSL 433■■■□□ 2.875e-8■□□□□ 11
SAFB2Q14151 SPG7-214ENST00000566371 581 ntTSL 331.21■■■□□ 2.595e-8■□□□□ 11
SAFB2Q14151 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.835e-8■□□□□ 11
SAFB2Q14151 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.075e-8■□□□□ 11
SAFB2Q14151 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC16.81■□□□□ 0.285e-8■□□□□ 11
SAFB2Q14151 BRCA1-230ENST00000634433 2534 ntTSL 59.44□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-7■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 RPL32P3-205ENST00000507287 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.584e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 AC026412.1-205ENST00000522848 1130 ntTSL 231.23■■■□□ 2.594e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.124e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 AC026412.1-204ENST00000507505 1009 ntTSL 1 (best)23.42■■□□□ 1.344e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.884e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.66■□□□□ 0.584e-6■□□□□ 10.9
SAFB2Q14151 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.314e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.634e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.454e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.114e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 TPTE-204ENST00000618007 2150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 TPTE-202ENST00000612746 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 RICTOR-206ENST00000510711 3126 ntTSL 212.53□□□□□ -0.44e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 TPTE-205ENST00000622113 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.74e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 MMS22L-208ENST00000508976 2245 ntTSL 29.9□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 RICTOR-209ENST00000514735 686 ntTSL 39.65□□□□□ -0.864e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.944e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 MMS22L-211ENST00000511335 8380 ntTSL 1 (best)7.73□□□□□ -1.174e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 RICTOR-208ENST00000513566 1762 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.244e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 MMS22L-203ENST00000482634 436 ntTSL 36.92□□□□□ -1.34e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.354e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 MMS22L-206ENST00000506256 732 ntTSL 35.02□□□□□ -1.614e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 MMS22L-204ENST00000484170 435 ntTSL 34.86□□□□□ -1.634e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.754e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 RICTOR-207ENST00000511516 7312 ntTSL 1 (best)3.99□□□□□ -1.774e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.984e-6■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.271e-8■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 PSMG4-210ENST00000509933 2241 ntTSL 219.94■□□□□ 0.781e-8■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 PSMG4-208ENST00000454610 2323 ntTSL 218.77■□□□□ 0.61e-8■□□□□ 10.8
SAFB2Q14151 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.754e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.634e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 529.33■■■□□ 2.294e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.974e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 326.17■■□□□ 1.784e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 426.17■■□□□ 1.784e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 423.2■■□□□ 1.34e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.084e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RNGTT-204ENST00000627296 2017 ntTSL 220.52■□□□□ 0.884e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.564e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.724e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RFWD2-206ENST00000461830 2131 ntTSL 510.33□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 27.89□□□□□ -1.154e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 34.81□□□□□ -1.644e-6■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 522.67■■□□□ 1.224e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.934e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 520.84■□□□□ 0.934e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 520.84■□□□□ 0.934e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 519.94■□□□□ 0.784e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.624e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.614e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.574e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-285ENST00000627152 846 ntTSL 518.47■□□□□ 0.554e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-342ENST00000631366 751 ntTSL 517.44■□□□□ 0.384e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-236ENST00000599448 780 ntTSL 517.44■□□□□ 0.384e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 517.36■□□□□ 0.374e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-336ENST00000631189 1156 ntTSL 516.87■□□□□ 0.294e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-312ENST00000628823 616 ntTSL 516.75■□□□□ 0.274e-8■□□□□ 10.7
SAFB2Q14151 LINC00969-296ENST00000627718 510 ntTSL 516.69■□□□□ 0.264e-8■□□□□ 10.7
Retrieved 100 of 3,296 protein–RNA pairs in 164.1 ms