Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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RAB33AQ14088 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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RAB33AQ14088 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB33AQ14088 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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RAB33AQ14088 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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RAB33AQ14088 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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RAB33AQ14088 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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RAB33AQ14088 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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RAB33AQ14088 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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RAB33AQ14088 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB33AQ14088 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
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