Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CUL4BQ13620 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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