Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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