Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNQ13421 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSLNQ13421 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
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