Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLF1Q13351 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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