Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATMQ13315 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATMQ13315 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATMQ13315 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATMQ13315 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATMQ13315 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATMQ13315 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATMQ13315 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATMQ13315 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATMQ13315 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATMQ13315 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATMQ13315 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATMQ13315 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATMQ13315 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATMQ13315 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATMQ13315 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATMQ13315 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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