Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA4Q13156 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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