Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RLFQ13129 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLFQ13129 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLFQ13129 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLFQ13129 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLFQ13129 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RLFQ13129 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLFQ13129 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLFQ13129 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLFQ13129 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLFQ13129 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLFQ13129 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RLFQ13129 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RLFQ13129 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLFQ13129 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RLFQ13129 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLFQ13129 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLFQ13129 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RLFQ13129 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RLFQ13129 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RLFQ13129 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RLFQ13129 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RLFQ13129 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RLFQ13129 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLFQ13129 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLFQ13129 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLFQ13129 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLFQ13129 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLFQ13129 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLFQ13129 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLFQ13129 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLFQ13129 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLFQ13129 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RLFQ13129 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLFQ13129 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLFQ13129 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RLFQ13129 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RLFQ13129 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLFQ13129 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RLFQ13129 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLFQ13129 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLFQ13129 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLFQ13129 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLFQ13129 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLFQ13129 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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