Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX4Q12846 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STX4Q12846 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
STX4Q12846 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STX4Q12846 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STX4Q12846 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STX4Q12846 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STX4Q12846 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STX4Q12846 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STX4Q12846 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STX4Q12846 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
STX4Q12846 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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