Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TROQ12816 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TROQ12816 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TROQ12816 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TROQ12816 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TROQ12816 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TROQ12816 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TROQ12816 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TROQ12816 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TROQ12816 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TROQ12816 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TROQ12816 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TROQ12816 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TROQ12816 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TROQ12816 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TROQ12816 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TROQ12816 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TROQ12816 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TROQ12816 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TROQ12816 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TROQ12816 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TROQ12816 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TROQ12816 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TROQ12816 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TROQ12816 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TROQ12816 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TROQ12816 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TROQ12816 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TROQ12816 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TROQ12816 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TROQ12816 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TROQ12816 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TROQ12816 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TROQ12816 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TROQ12816 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TROQ12816 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TROQ12816 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TROQ12816 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
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