Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 NAG1YGR031C-A 492 nt4.78□□□□□ -1.64
NFI1Q12216 YIL163CYIL163C 354 nt4.78□□□□□ -1.64
NFI1Q12216 YRA2YKL214C 612 nt4.78□□□□□ -1.64
NFI1Q12216 RER2YBR002C 861 nt4.78□□□□□ -1.64
NFI1Q12216 MCM2YBL023C 2607 nt4.78□□□□□ -1.64
NFI1Q12216 SPO77YLR341W 1434 nt4.78□□□□□ -1.64
NFI1Q12216 KEX1YGL203C 2190 nt4.77□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 RGP1YDR137W 1992 nt4.77□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 KTI12YKL110C 942 nt4.77□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 YPL077CYPL077C 723 nt4.77□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 VPS36YLR417W 1701 nt4.77□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 BRE2YLR015W 1518 nt4.77□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 HXT14YNL318C 1623 nt4.76□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 SPL2YHR136C 447 nt4.76□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 PHO12YHR215W 1404 nt4.76□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 PHO11YAR071W 1404 nt4.76□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 BBC1YJL020C 3474 nt4.76□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 YLR152CYLR152C 1731 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 AIR2YDL175C 1035 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 EGD2YHR193C 525 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 YJL215CYJL215C 360 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 RFU1YLR073C 603 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 SET6YPL165C 1122 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 ADE4YMR300C 1533 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 OSH2YDL019C 3852 nt4.75□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 NDC1YML031W 1968 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 MPS3YJL019W 2049 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 YDR274CYDR274C 372 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 CBF1YJR060W 1056 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 SNO1YMR095C 675 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 SCW10YMR305C 1170 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 MFM1YPL060W 1242 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 MRI1YPR118W 1236 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 QCR2YPR191W 1107 nt4.74□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 GGA1YDR358W 1674 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 FMP30YPL103C 1407 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 OLE1YGL055W 1533 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 EFM4YIL064W 774 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 YJL068CYJL068C 900 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 ETT1YOR051C 1239 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 DCS2YOR173W 1062 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 FUI1YBL042C 1920 nt4.73□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 SUL2YLR092W 2682 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 ADY2YCR010C 852 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 SCM3YDL139C 672 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 DAS2YDR020C 699 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 RRP45YDR280W 918 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 PFA5YDR459C 1125 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 ORM2YLR350W 651 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 ETR1YBR026C 1143 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 YBR219CYBR219C 384 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 THP1YOL072W 1368 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 SWC3YAL011W 1878 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 CDC9YDL164C 2268 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 LAS21YJL062W 2493 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 RAD1YPL022W 3303 nt4.72□□□□□ -1.65
NFI1Q12216 NUG1YER006W 1563 nt4.71□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 RPS11AYDR025W 471 nt4.71□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 MRS3YJL133W 945 nt4.71□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 YLR194CYLR194C 765 nt4.71□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 YIM1YMR152W 1098 nt4.71□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 FRA2YGL220W 363 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 NAT2YGR147C 867 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 ISA1YLL027W 753 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 ARG1YOL058W 1263 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 MET31YPL038W 534 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 YCL041CYCL041C 495 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 PAN1YIR006C 4443 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 APM1YPL259C 1428 nt4.7□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 ROT2YBR229C 2865 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 YCR050CYCR050C 309 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 SLC1YDL052C 912 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 RRP1YDR087C 837 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 MOB2YFL034C-B 864 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 SEH1YGL100W 1050 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 RPL8AYHL033C 771 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 SAE3YHR079C-A 276 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 AST1YBL069W 1290 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 TIM54YJL054W 1437 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 TFA1YKL028W 1449 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 PIM1YBL022C 3402 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 SMF1YOL122C 1728 nt4.69□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 IWR1YDL115C 1062 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 TRS23YDR246W 660 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 CIA2YHR122W 696 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 RPB4YJL140W 666 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 ISY1YJR050W 708 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 YMR245WYMR245W 621 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 GPI12YMR281W 915 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 PCL10YGL134W 1302 nt4.68□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 MSH1YHR120W 2880 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 SIR1YKR101W 1965 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 PUT2YHR037W 1728 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 ATP5YDR298C 639 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 LPP1YDR503C 825 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 SLO1YER180C-A 258 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 DSD1YGL196W 1287 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 TIM21YGR033C 720 nt4.67□□□□□ -1.66
NFI1Q12216 YGR139WYGR139W 339 nt4.67□□□□□ -1.66
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