Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD3Q0VAK6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD3Q0VAK6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms