Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM27E3Q08E93 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms