Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN5Q08AF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN5Q08AF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms